122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3670 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  100 
 
 		 274 aa  554  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  49.49 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  44.82 
 
 		 284 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000004715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  45.07 
 
 		 290 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  45.16 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0951  TonB family protein  45.82 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00168123  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1053  TonB family protein  44.08 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0250994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  40.07 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  41.28 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  51.52 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  43.16 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  43.96 
 
 		 218 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  28.52 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  44.44 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  44.44 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  35.48 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  37.97 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  39.08 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  40.96 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  38.82 
 
 		 117 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  34.15 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  40.24 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  38.27 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  34.12 
 
 		 233 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  40.79 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  41.25 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  44.93 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  29.37 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  38.75 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  41.25 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  38.96 
 
 		 228 aa  52.4  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  39.02 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  39.24 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  38.75 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  37.5 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  32.47 
 
 		 115 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  40.24 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  36.59 
 
 		 233 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  35.71 
 
 		 441 aa  49.7  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  37.5 
 
 		 443 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  37.93 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  38.67 
 
 		 256 aa  49.3  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  37.93 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  34.15 
 
 		 245 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  37.5 
 
 		 275 aa  48.9  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  34.21 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  40 
 
 		 253 aa  48.9  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  38.6 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  46 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  38.89 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0623  TonB family protein  35.8 
 
 		 211 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.480841  normal  0.103893 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  37.5 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  37.5 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  35.59 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  36.36 
 
 		 292 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  34.94 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  37.5 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  42.86 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  37.35 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  40.74 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  40.35 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  34.15 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0008  TonB family protein  35.9 
 
 		 222 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440942 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  40.74 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  30.77 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  34.15 
 
 		 112 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  33.7 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  39.47 
 
 		 289 aa  46.2  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  37.35 
 
 		 228 aa  46.6  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  37.7 
 
 		 243 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  37.7 
 
 		 243 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  33.93 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  37.7 
 
 		 226 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  36.59 
 
 		 212 aa  46.6  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  31.82 
 
 		 223 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  35.06 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  35.37 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  33.33 
 
 		 184 aa  45.8  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  34.67 
 
 		 219 aa  45.8  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  35.37 
 
 		 288 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  38.75 
 
 		 248 aa  45.8  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  34.09 
 
 		 219 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  37.7 
 
 		 226 aa  45.4  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  37.5 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  36.84 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  33.93 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  34.62 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  37.7 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  37.5 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  36.84 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  33.78 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  40.38 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  37.5 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  36.25 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  31.58 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  34.55 
 
 		 110 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  34.18 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  44.23 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  33.78 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  32.5 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>