101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0623 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0623  TonB family protein  100 
 
 
211 aa  416  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.480841  normal  0.103893 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  41.03 
 
 
117 aa  54.7  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  35.44 
 
 
233 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  34.62 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  34.62 
 
 
231 aa  52.8  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0008  TonB family protein  42.31 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440942 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  36.59 
 
 
212 aa  52.4  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  37.21 
 
 
112 aa  52  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  39.47 
 
 
289 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  36.71 
 
 
276 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  37.29 
 
 
443 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  41.38 
 
 
245 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  38.46 
 
 
138 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  38.75 
 
 
215 aa  50.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  44.83 
 
 
174 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  35.9 
 
 
228 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0951  TonB family protein  33.33 
 
 
295 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00168123  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  33.33 
 
 
290 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  45.45 
 
 
270 aa  49.3  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  35.8 
 
 
274 aa  48.9  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  43.64 
 
 
184 aa  49.3  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  33.33 
 
 
284 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000004715  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  36.78 
 
 
237 aa  48.9  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  43.1 
 
 
248 aa  48.5  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  25.4 
 
 
252 aa  48.5  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  33.33 
 
 
403 aa  48.5  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  43.1 
 
 
193 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  43.1 
 
 
274 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  37.8 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  39.74 
 
 
275 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  39.02 
 
 
266 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  34.62 
 
 
283 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1053  TonB family protein  32.1 
 
 
289 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0250994  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  39.02 
 
 
266 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  41.82 
 
 
221 aa  47.4  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  29.51 
 
 
203 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  41.82 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  28.69 
 
 
203 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  38.46 
 
 
267 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  29.66 
 
 
203 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  34.62 
 
 
237 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  32.5 
 
 
249 aa  46.2  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3773  TonB family protein  31.58 
 
 
475 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.854647  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  30.77 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  34.18 
 
 
244 aa  45.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  34.18 
 
 
244 aa  45.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  35.44 
 
 
270 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  38.1 
 
 
273 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  28.77 
 
 
243 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3515  TonB family protein  31.33 
 
 
152 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0209136  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  28.77 
 
 
243 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  34.62 
 
 
291 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  34.15 
 
 
441 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  42.11 
 
 
417 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  35.44 
 
 
264 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  32.05 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  28.77 
 
 
226 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  30.14 
 
 
226 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  33.75 
 
 
121 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  33.33 
 
 
140 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  43.86 
 
 
271 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  41.07 
 
 
370 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  35.37 
 
 
285 aa  44.3  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  31.71 
 
 
273 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  31.71 
 
 
277 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  27.5 
 
 
368 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  30.14 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  42.86 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  34.18 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  30.77 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  32.1 
 
 
137 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  34.18 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  38.98 
 
 
287 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  33.9 
 
 
507 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  36.84 
 
 
405 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  42.11 
 
 
397 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  30.26 
 
 
238 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  40 
 
 
373 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  40 
 
 
369 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  40 
 
 
370 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  28.77 
 
 
245 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  34.15 
 
 
274 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  34.15 
 
 
286 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  40 
 
 
243 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  32.73 
 
 
349 aa  42.4  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  38.3 
 
 
239 aa  42.4  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  32.1 
 
 
203 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  40 
 
 
243 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  34.15 
 
 
275 aa  42.4  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  37.29 
 
 
288 aa  42.4  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  48.98 
 
 
295 aa  42  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  34.57 
 
 
390 aa  42  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  30.86 
 
 
137 aa  42  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  31.17 
 
 
138 aa  42  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  34.18 
 
 
232 aa  42  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  40 
 
 
243 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  40 
 
 
244 aa  42  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  30.34 
 
 
269 aa  41.6  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  29.27 
 
 
285 aa  41.6  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  43.4 
 
 
242 aa  41.6  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>