122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3763 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  96.22 
 
 		 370 aa  721    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  100 
 
 		 373 aa  763    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  87.08 
 
 		 370 aa  637    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  96.49 
 
 		 369 aa  723    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  98.6 
 
 		 370 aa  721    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  78.11 
 
 		 369 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  77.81 
 
 		 371 aa  578  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  77.25 
 
 		 371 aa  578  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  70.51 
 
 		 371 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  48.86 
 
 		 362 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  47.97 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  46.09 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  48.47 
 
 		 363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  47.97 
 
 		 396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  44.82 
 
 		 361 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  33.89 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  43.59 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  42.05 
 
 		 207 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  42.05 
 
 		 207 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  40.91 
 
 		 207 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  40.91 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  48.57 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  47.83 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  47.83 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  47.83 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  47.83 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  42.05 
 
 		 206 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  40.91 
 
 		 206 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  41.03 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  39.77 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  39.74 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  41.03 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  40 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  40.28 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  43.48 
 
 		 204 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  39.24 
 
 		 131 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  41.54 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  36.84 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  38.75 
 
 		 203 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  31.01 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  37.68 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  38.46 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  38.46 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  39.44 
 
 		 203 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  38.46 
 
 		 203 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  38.46 
 
 		 203 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  37.18 
 
 		 203 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  38.46 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  36.71 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  40 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  43.08 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  34.67 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  31.43 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  32.39 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  35.8 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  33.8 
 
 		 203 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  31.58 
 
 		 202 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  30.38 
 
 		 207 aa  55.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  32.91 
 
 		 202 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  34.92 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  34.67 
 
 		 205 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  35.53 
 
 		 205 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  37.7 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  41.94 
 
 		 458 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  28.57 
 
 		 277 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  33.8 
 
 		 202 aa  53.1  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1889  hypothetical protein  34.92 
 
 		 462 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  31.08 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  35.48 
 
 		 112 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  30.14 
 
 		 228 aa  49.7  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  30.77 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  30.77 
 
 		 270 aa  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  31.94 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  31.94 
 
 		 305 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  29.69 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  29.85 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  40.38 
 
 		 93 aa  47  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  33.75 
 
 		 252 aa  47  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05000  TonB protein  33.8 
 
 		 290 aa  47  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00767831  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  38.71 
 
 		 248 aa  46.2  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  32.88 
 
 		 582 aa  46.2  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  34.38 
 
 		 242 aa  46.2  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  31.58 
 
 		 115 aa  46.2  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  34.92 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  38.46 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2868  hypothetical protein  31.08 
 
 		 148 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  35 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  35 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  32.26 
 
 		 251 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4060  TonB family protein  28.95 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.910663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  35 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  30.77 
 
 		 212 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  35 
 
 		 239 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  35 
 
 		 239 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  35 
 
 		 239 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  28.21 
 
 		 209 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  35.29 
 
 		 269 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  35 
 
 		 244 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  35 
 
 		 243 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  32.39 
 
 		 121 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>