225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1735 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  100 
 
 		 228 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  46.15 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  37.01 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  39.77 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  29.05 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  38.64 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  36.61 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  36.61 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  31.68 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  31.19 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  29.52 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  35.07 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  34.04 
 
 		 277 aa  68.6  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  32.03 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  33.33 
 
 		 225 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  34.83 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  25.12 
 
 		 204 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  28.44 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  26.97 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  30.69 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  31.18 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  31.18 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  40 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  31.93 
 
 		 700 aa  65.9  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  31.18 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  36.25 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  33.61 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  31 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  32.18 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  30.95 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  38.71 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  32.26 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  46.03 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  28.04 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  31.62 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  31.03 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  28.48 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  31.03 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  28.32 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  34.44 
 
 		 467 aa  62.8  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  28.48 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  27.03 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  30.84 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  41.56 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  37.04 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  33.75 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  27.64 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  34.38 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  41.77 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  30.68 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  38.1 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  28.44 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  32.26 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  30.11 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  32.61 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  30.83 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  27.7 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  29.1 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  36.11 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  26.03 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  28.8 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  38.03 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  33.33 
 
 		 363 aa  58.5  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  31.87 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  40.35 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  35.96 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  35.37 
 
 		 582 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  28.26 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  27.03 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  33.68 
 
 		 283 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  21.52 
 
 		 405 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  38.6 
 
 		 115 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  33.33 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  36.71 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  28.21 
 
 		 202 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  37.97 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  39.53 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  27.17 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  37.8 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  30.59 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  26.74 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  33.33 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  35.29 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  33.33 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  37.97 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  33.77 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  28.4 
 
 		 369 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  31.01 
 
 		 447 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.08 
 
 		 459 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  29.76 
 
 		 354 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  30.77 
 
 		 319 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  32.05 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  31.34 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  38.75 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  38.75 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  37.33 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  33.33 
 
 		 371 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  38.75 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  33.33 
 
 		 265 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  35.37 
 
 		 112 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>