127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1004 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  33.06 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  24.49 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  39.13 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  27.59 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  35.62 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  32.03 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  30.85 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  42.86 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  28.34 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  29 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  34.21 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  26.27 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  29.7 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  39.22 
 
 		 310 aa  55.1  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  33.33 
 
 		 257 aa  54.3  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0849  TonB, putative  28.29 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00146132  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  40.79 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  34.92 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  29.63 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  40.26 
 
 		 283 aa  52  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  39.47 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  24.58 
 
 		 298 aa  52  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  29.61 
 
 		 301 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  35.06 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  29.58 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  43.1 
 
 		 174 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  31.03 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  29.58 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  29.84 
 
 		 294 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  38.16 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000004715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0951  TonB family protein  38.16 
 
 		 295 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00168123  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  38.16 
 
 		 290 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  38.78 
 
 		 299 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  22.67 
 
 		 288 aa  48.9  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1053  TonB family protein  38.16 
 
 		 289 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0250994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  25 
 
 		 292 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  36.99 
 
 		 241 aa  48.5  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  31.58 
 
 		 221 aa  48.5  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  37.25 
 
 		 507 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  27.64 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  33.77 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  25.65 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  38.78 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  38.78 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  35.9 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  30.77 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  35.29 
 
 		 319 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  36.84 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  24.27 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  36.73 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  31.58 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  24.1 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  25.14 
 
 		 324 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  23.63 
 
 		 291 aa  46.2  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  23.63 
 
 		 291 aa  46.2  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0008  TonB family protein  33.77 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  23.26 
 
 		 308 aa  45.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  30.85 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  26.12 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  37.84 
 
 		 208 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  37.25 
 
 		 292 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  31.71 
 
 		 269 aa  45.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  29.52 
 
 		 484 aa  45.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  37.25 
 
 		 297 aa  45.8  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  30.91 
 
 		 292 aa  45.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0183  TonB family protein  50 
 
 		 251 aa  45.4  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.144886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  41.46 
 
 		 245 aa  45.1  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  27.85 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  35.29 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  46.81 
 
 		 441 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  27.85 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  27.85 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  48.94 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  33.9 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  34.04 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  42.55 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  35.71 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  34.21 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  37.1 
 
 		 164 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  37.89 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  25.64 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1262  protein TonB  25.78 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  45.65 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  28.57 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  45.65 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  45.65 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  40 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  33.33 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  34.04 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  34.15 
 
 		 485 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  24.76 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  32.31 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  42.55 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  37.1 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  32.76 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  37.5 
 
 		 443 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  33.33 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  35.53 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  31.63 
 
 		 295 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>