94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2576 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  100 
 
 		 294 aa  593  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  46.38 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  44.48 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  42.55 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  35.48 
 
 		 333 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  39.58 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  39.24 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  35.87 
 
 		 288 aa  155  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  38.14 
 
 		 297 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  38.14 
 
 		 319 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  38.68 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  39.15 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  38.68 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  38.1 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  35.53 
 
 		 292 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  36.84 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  36.84 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  37.5 
 
 		 328 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  36.84 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  36.49 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  36.89 
 
 		 300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  33.57 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  36.49 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  35.51 
 
 		 294 aa  139  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  36.3 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  37.16 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  32.74 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  31.8 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  32.39 
 
 		 286 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  35.5 
 
 		 306 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  36.12 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  31.53 
 
 		 286 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  31.79 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  31.79 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  44.67 
 
 		 279 aa  125  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  37.64 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  34.52 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  58 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  33.57 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  33.56 
 
 		 296 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  32.86 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  32.14 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  33.95 
 
 		 288 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  30.03 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  30.74 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  32.65 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  28.92 
 
 		 323 aa  89.7  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  37.4 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  37.39 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1646  TonB family protein  36.96 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0972936  hitchhiker  0.00122452 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1978  TonB family protein  36.96 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0237  TonB family protein  29.34 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2711  GETHR pentapeptide  36.56 
 
 		 654 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.653885  hitchhiker  0.000850272 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  36.08 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2689  TonB family protein  32.04 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2313  hypothetical protein  32.04 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  35.53 
 
 		 308 aa  52.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  34.18 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2891  TonB family protein  27.69 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  36.84 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  46.94 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  29.03 
 
 		 297 aa  49.7  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  51.02 
 
 		 275 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  24.27 
 
 		 281 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2717  TonB family protein  28.1 
 
 		 281 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  28.81 
 
 		 282 aa  48.9  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  33.33 
 
 		 263 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  37.25 
 
 		 239 aa  48.9  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2668  TonB family protein  32.91 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  32.86 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  40.35 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  29.67 
 
 		 235 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  27.47 
 
 		 285 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  32.22 
 
 		 411 aa  45.8  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  30.59 
 
 		 295 aa  45.8  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  40.38 
 
 		 507 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  30.56 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  24.82 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2895  TonB family protein  27.84 
 
 		 236 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  36.67 
 
 		 164 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  27.22 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0858  TonB-dependent receptor, putative  31.53 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00190793  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3297  TonB family protein  27.84 
 
 		 230 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  36.67 
 
 		 202 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  25.33 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  35.53 
 
 		 220 aa  43.5  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  29.03 
 
 		 286 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  29.2 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  44 
 
 		 273 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  27.91 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  42.86 
 
 		 270 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  35.94 
 
 		 291 aa  42.4  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  32.86 
 
 		 235 aa  42.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  42.86 
 
 		 264 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>