52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2856 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  100 
 
 		 306 aa  621  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  83.28 
 
 		 328 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  63.16 
 
 		 304 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  63.16 
 
 		 304 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  60.86 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  41.58 
 
 		 285 aa  188  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  39.73 
 
 		 282 aa  188  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  39.86 
 
 		 286 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  41.72 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  36.9 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  41.38 
 
 		 304 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  36.9 
 
 		 295 aa  175  9e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  38.26 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  40.07 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  38.79 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  35.71 
 
 		 296 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  39.8 
 
 		 287 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  35.31 
 
 		 307 aa  152  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  39.87 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  35.5 
 
 		 294 aa  132  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0237  TonB family protein  31.51 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  32.04 
 
 		 316 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  33.45 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  33.92 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  31.14 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  30.8 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  33.21 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  33.56 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  30.77 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  31.46 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  31.46 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  31.3 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  29.62 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  27.84 
 
 		 288 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  30.56 
 
 		 294 aa  95.5  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  31.38 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  31.38 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  31.62 
 
 		 286 aa  92.4  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  28.35 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  29.87 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  34.38 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  29.66 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  27.95 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  29.55 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  25.89 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  31.25 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  24.92 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  34.06 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  33.64 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  23.18 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2711  GETHR pentapeptide  38.33 
 
 		 654 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.653885  hitchhiker  0.000850272 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  37.31 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>