89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0510 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  100 
 
 
250 aa  511  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  29.58 
 
 
288 aa  105  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  40.15 
 
 
310 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  29.1 
 
 
294 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  26.71 
 
 
292 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  43.69 
 
 
286 aa  95.9  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  27.02 
 
 
297 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  43 
 
 
297 aa  93.2  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  41.75 
 
 
279 aa  92  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  38.46 
 
 
300 aa  92  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  26.67 
 
 
300 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  40 
 
 
301 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  40 
 
 
301 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  40 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  26.76 
 
 
297 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  39.47 
 
 
295 aa  89.4  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  39.6 
 
 
319 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  41 
 
 
298 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  40.59 
 
 
316 aa  87.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  38 
 
 
300 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  38 
 
 
299 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  34.62 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  36.8 
 
 
333 aa  82  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  37.39 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  36.04 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  25 
 
 
288 aa  78.6  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  33.59 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  34.17 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  34.17 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  29.69 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  30.71 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  32.67 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  29.92 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  33.61 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  28.12 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  32.43 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2711  GETHR pentapeptide  46.15 
 
 
654 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.653885  hitchhiker  0.000850272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  23.86 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  33.64 
 
 
306 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  29.13 
 
 
304 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  26.67 
 
 
283 aa  59.7  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1646  TonB family protein  32.32 
 
 
275 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0972936  hitchhiker  0.00122452 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1978  TonB family protein  32.32 
 
 
275 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  29.13 
 
 
286 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  29.81 
 
 
323 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  29.81 
 
 
323 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  35.16 
 
 
336 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  28.03 
 
 
328 aa  55.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  30.28 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  30.28 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  26.77 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  26.99 
 
 
304 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  27 
 
 
295 aa  52.4  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  34.41 
 
 
292 aa  52  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2313  hypothetical protein  29.47 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8827  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2689  TonB family protein  29.47 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  25.69 
 
 
242 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  25.69 
 
 
242 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  38 
 
 
443 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  34.67 
 
 
315 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  25.22 
 
 
251 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  34.62 
 
 
265 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  31.87 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  28.89 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2891  TonB family protein  24.74 
 
 
283 aa  46.2  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  29.67 
 
 
256 aa  45.8  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  31.82 
 
 
411 aa  45.8  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  36.11 
 
 
269 aa  45.8  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  31.17 
 
 
285 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  30 
 
 
264 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  25.53 
 
 
317 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  30 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1643  TonB family protein  31.91 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0339167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  32.91 
 
 
317 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  35.14 
 
 
269 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2717  TonB family protein  23.08 
 
 
281 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  29.41 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  29.41 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  29.41 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  25.49 
 
 
268 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  32 
 
 
263 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  37.78 
 
 
330 aa  42.7  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  26.8 
 
 
282 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  22.44 
 
 
281 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3297  TonB family protein  25.81 
 
 
230 aa  42.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2895  TonB family protein  25.81 
 
 
236 aa  42.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  31.08 
 
 
248 aa  42.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11790  TonB family protein  31.03 
 
 
314 aa  42.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  30.77 
 
 
88 aa  42  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>