50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1088 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  100 
 
 		 282 aa  573  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  69.61 
 
 		 285 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  71.58 
 
 		 304 aa  394  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  72 
 
 		 304 aa  388  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  71.06 
 
 		 286 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  71.64 
 
 		 286 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  66.91 
 
 		 287 aa  374  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  64.96 
 
 		 283 aa  349  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  65.11 
 
 		 287 aa  331  7.000000000000001e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  64.73 
 
 		 296 aa  316  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  52.17 
 
 		 296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  41.64 
 
 		 304 aa  198  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  41.64 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  43.69 
 
 		 304 aa  192  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  40.2 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  39.73 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  35.23 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  33.08 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  34.32 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  32.49 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  31.63 
 
 		 316 aa  118  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  30.11 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  30.95 
 
 		 292 aa  92.4  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0237  TonB family protein  30.47 
 
 		 256 aa  92  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  29.58 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  28.72 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  27.08 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  28.11 
 
 		 319 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  26.26 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  26.26 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  28.88 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  29.8 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  27.27 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  26.62 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  26.67 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  27.99 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  27.37 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  34.75 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  25 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  23.66 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  27.6 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  27.6 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  24.44 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  28.12 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  26.49 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  30.51 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  31.75 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  27.09 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  29.05 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  25 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>