87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2507 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  100 
 
 
316 aa  637    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  47.59 
 
 
294 aa  236  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  44.81 
 
 
307 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  38.03 
 
 
296 aa  202  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  37.91 
 
 
333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  37.66 
 
 
297 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  37.03 
 
 
319 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  33.77 
 
 
291 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  33.77 
 
 
291 aa  159  7e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  35.18 
 
 
300 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  37.06 
 
 
298 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  35.5 
 
 
301 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  34.85 
 
 
301 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  34 
 
 
300 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  32.44 
 
 
292 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  35.18 
 
 
301 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  32.82 
 
 
297 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  32.78 
 
 
294 aa  149  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  32.52 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  35.33 
 
 
291 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  37.96 
 
 
299 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  34.21 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  31.15 
 
 
288 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  33.11 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  31.99 
 
 
294 aa  132  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  30.99 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  33.77 
 
 
310 aa  129  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  35.64 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  32.36 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  31.39 
 
 
304 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  49.62 
 
 
279 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  31.39 
 
 
304 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  31.21 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  32.73 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  29.87 
 
 
287 aa  115  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  32.97 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  30.89 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  29.64 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  31.66 
 
 
287 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  29.81 
 
 
304 aa  106  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  30.25 
 
 
283 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  29.71 
 
 
296 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  29.81 
 
 
286 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  29.05 
 
 
295 aa  99.4  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  26.97 
 
 
295 aa  99.4  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  29.58 
 
 
296 aa  96.3  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  40.59 
 
 
250 aa  86.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  35.88 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  35.88 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2711  GETHR pentapeptide  38.18 
 
 
654 aa  76.6  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.653885  hitchhiker  0.000850272 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0237  TonB family protein  28.09 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1978  TonB family protein  32.54 
 
 
275 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1646  TonB family protein  32.54 
 
 
275 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0972936  hitchhiker  0.00122452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  32.5 
 
 
292 aa  56.2  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  31.25 
 
 
308 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  24.1 
 
 
282 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  37.35 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  30.25 
 
 
235 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  35.94 
 
 
295 aa  49.7  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  38.33 
 
 
202 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  34.18 
 
 
248 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  36.62 
 
 
164 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  33.33 
 
 
244 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2891  TonB family protein  26.47 
 
 
283 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  37.14 
 
 
277 aa  46.6  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2313  hypothetical protein  28.57 
 
 
264 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8827  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2689  TonB family protein  28.57 
 
 
264 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  33.33 
 
 
269 aa  46.6  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2717  TonB family protein  29.55 
 
 
281 aa  46.2  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  26.26 
 
 
201 aa  46.2  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  36.51 
 
 
274 aa  46.2  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  29.55 
 
 
281 aa  45.8  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  24.6 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  40.82 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  37.5 
 
 
261 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  41.67 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  30.12 
 
 
272 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  40.82 
 
 
443 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  42.86 
 
 
275 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  35.56 
 
 
507 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  40.82 
 
 
270 aa  43.5  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  32.1 
 
 
246 aa  43.5  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  38.78 
 
 
287 aa  43.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  26.24 
 
 
282 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  38.78 
 
 
296 aa  43.1  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0878  TonB family protein  41.43 
 
 
248 aa  42.4  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  30.12 
 
 
336 aa  42.4  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>