55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3981 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  100 
 
 		 296 aa  587  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  56.47 
 
 		 285 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  55.2 
 
 		 286 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  55.44 
 
 		 304 aa  309  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  55.09 
 
 		 286 aa  308  9e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  52.17 
 
 		 282 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  51.6 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  60.57 
 
 		 296 aa  289  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  52.71 
 
 		 283 aa  281  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  53.76 
 
 		 287 aa  265  7e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  49.64 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  40.07 
 
 		 304 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  39.72 
 
 		 304 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  38.79 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  38.79 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  37.72 
 
 		 304 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  33.45 
 
 		 296 aa  149  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  34.03 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  35.98 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  34.21 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  31.31 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  31.67 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  30.34 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0237  TonB family protein  31.64 
 
 		 256 aa  94  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  28.32 
 
 		 294 aa  92.4  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  28.52 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  28.81 
 
 		 319 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  28.29 
 
 		 297 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  28.57 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  29.29 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  28.09 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  29.41 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  28.62 
 
 		 286 aa  85.5  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  28.09 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  30.36 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  28.09 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  29.92 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  24.91 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  30.86 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  28.77 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  29.48 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  29.48 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  39.82 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  29.2 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  31.3 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  30.56 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  25.54 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  26.37 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  24.34 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  33.86 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  35.64 
 
 		 219 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  40 
 
 		 88 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  30.3 
 
 		 246 aa  45.8  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1646  TonB family protein  32.43 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0972936  hitchhiker  0.00122452 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1978  TonB family protein  32.43 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>