85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3748 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  100 
 
 		 88 aa  176  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  42.05 
 
 		 279 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0567  TonB family protein  41.38 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.584619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  42.22 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  40.7 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  42.11 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  42.11 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  42.11 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  41.38 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  39.36 
 
 		 273 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  41.18 
 
 		 330 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  37.63 
 
 		 265 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  37.18 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  36.26 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  37.93 
 
 		 269 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  37.36 
 
 		 286 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2581  TonB family protein  37.5 
 
 		 294 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.632604  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  43.75 
 
 		 291 aa  53.9  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  45.95 
 
 		 308 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  37.93 
 
 		 451 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  31.17 
 
 		 263 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2994  TonB family protein  43.08 
 
 		 294 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.7532  normal  0.152882 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0922  putative TonB protein  37.5 
 
 		 294 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.702209  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  40.58 
 
 		 285 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  42.03 
 
 		 219 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  33.7 
 
 		 248 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  33.7 
 
 		 248 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  37.36 
 
 		 292 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0352  TonB-like  46.77 
 
 		 304 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  40.3 
 
 		 289 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  34.09 
 
 		 267 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  34.09 
 
 		 267 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  37.5 
 
 		 269 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1323  hypothetical protein  31.76 
 
 		 245 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.329029  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  31.82 
 
 		 264 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  38.96 
 
 		 248 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  34.72 
 
 		 269 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  32.61 
 
 		 244 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  30.68 
 
 		 264 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  37.88 
 
 		 243 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  30.85 
 
 		 248 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  35.71 
 
 		 237 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  39.13 
 
 		 315 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  37.88 
 
 		 243 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1620  TonB family protein  38.2 
 
 		 394 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.381372 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  37.5 
 
 		 277 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  37.88 
 
 		 243 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1898  TonB family protein  38.2 
 
 		 366 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1616  TonB family protein  38.2 
 
 		 378 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  hitchhiker  0.00492157 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  32.97 
 
 		 292 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  30.68 
 
 		 264 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2960  hypothetical protein  30.59 
 
 		 245 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.999469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  39.06 
 
 		 292 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  32.56 
 
 		 220 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  37.88 
 
 		 258 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  40 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  32.31 
 
 		 411 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  38.81 
 
 		 266 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2072  hypothetical protein  40 
 
 		 246 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  32.61 
 
 		 250 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  29.07 
 
 		 336 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  31.94 
 
 		 248 aa  44.3  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  30.34 
 
 		 317 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1922  TonB family protein  36.99 
 
 		 208 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  42.19 
 
 		 495 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2275  TonB family protein  36.99 
 
 		 242 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2407  TonB family protein  30.95 
 
 		 343 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  37.14 
 
 		 304 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2822  TonB-like  33.7 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.628558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  33.33 
 
 		 235 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  36.36 
 
 		 317 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1699  TonB-dependent receptor, putative  38.3 
 
 		 237 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1184  TonB family protein  36.23 
 
 		 249 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3167  protein TolA  35.16 
 
 		 331 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  30.77 
 
 		 250 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  43.75 
 
 		 411 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  36.11 
 
 		 310 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  32.84 
 
 		 297 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  32.2 
 
 		 265 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  30.43 
 
 		 250 aa  40.8  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  36.62 
 
 		 264 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1636  TonB-like  41.18 
 
 		 235 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.484992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2528  TonB family protein  35 
 
 		 393 aa  40  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  30.77 
 
 		 246 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  36.54 
 
 		 244 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>