34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1616 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1898  TonB family protein  99.45 
 
 		 366 aa  685    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1616  TonB family protein  100 
 
 		 378 aa  709    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  hitchhiker  0.00492157 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1620  TonB family protein  80.64 
 
 		 394 aa  364  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.381372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3167  protein TolA  50.14 
 
 		 331 aa  250  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0855  TonB family protein  37.03 
 
 		 353 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1397  TonB family protein  35.09 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0922  putative TonB protein  41.9 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.702209  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  33.03 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  31.79 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2581  TonB family protein  43.12 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.632604  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  39.33 
 
 		 266 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  40 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  26.58 
 
 		 451 aa  53.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  33.96 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2994  TonB family protein  44.29 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.7532  normal  0.152882 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  30.43 
 
 		 267 aa  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  30.43 
 
 		 267 aa  49.7  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  30.43 
 
 		 267 aa  49.7  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  25.83 
 
 		 220 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  35.96 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  29.12 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  34.78 
 
 		 265 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  41.94 
 
 		 219 aa  47.4  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  22.12 
 
 		 2449 aa  47  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  38.2 
 
 		 88 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  32.97 
 
 		 267 aa  44.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  35.48 
 
 		 239 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  24.14 
 
 		 288 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  32.97 
 
 		 267 aa  44.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0725  TonB family protein  37.1 
 
 		 282 aa  44.3  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398336  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  28.75 
 
 		 269 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  33.33 
 
 		 291 aa  43.1  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  39.06 
 
 		 269 aa  43.1  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0296  TonB family protein  36.17 
 
 		 192 aa  43.1  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.501674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>