171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0203 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  100 
 
 		 248 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  91.53 
 
 		 248 aa  309  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  62.1 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  64.11 
 
 		 243 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  61.69 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  63.71 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  63.71 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  33.61 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  53.91 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  30.57 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  30.92 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  30.92 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  29.44 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  36.52 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  34.71 
 
 		 285 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  35.02 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  30.77 
 
 		 266 aa  92  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  32.63 
 
 		 292 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  38.12 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  41.84 
 
 		 256 aa  88.6  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  37.86 
 
 		 250 aa  88.6  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  32.53 
 
 		 292 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  43.48 
 
 		 269 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_004310  BR1668  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 308 aa  87  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  30.97 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  30.97 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  33.51 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  36.65 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  35.67 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  51.28 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  25.73 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  29.77 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  42.86 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  44.87 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  30.15 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  33.33 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  37.89 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1614  TonB protein  33.05 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  28.46 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  30.56 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  29.69 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  37.61 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  27.84 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  38.89 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  41.77 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  36.08 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  32.78 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  33.01 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  27.76 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  28.15 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  30.97 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3695  TonB family protein  26.24 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  31.34 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  31.97 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  38.75 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  25.43 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  39.71 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  25.54 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  32.22 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  29.43 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  23.67 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  35.71 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  35.29 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  33.04 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  33.04 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  37.5 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  34.29 
 
 		 2449 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  31.87 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  35.71 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  31.31 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  31.31 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  29.08 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  33.71 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  24.6 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  30.97 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  28.92 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  34.52 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1133  TonB family protein  30.49 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  35.44 
 
 		 495 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  35.23 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  30.63 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  30.81 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  29.03 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  27.57 
 
 		 354 aa  53.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3015  TonB family protein  33.58 
 
 		 443 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  31.51 
 
 		 171 aa  52.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  28.69 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  23.77 
 
 		 250 aa  52  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  32.22 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  23.3 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  41.67 
 
 		 164 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  27.23 
 
 		 451 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  23.57 
 
 		 319 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0451  TonB family protein  33.75 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103845  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  41.67 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1850  putative tonB protein  25.6 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.473086  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  24.02 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  40 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1624  TonB-like  30.58 
 
 		 285 aa  49.7  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0946322  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2822  TonB-like  28.21 
 
 		 114 aa  49.7  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.628558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>