80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2230 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  100 
 
 		 315 aa  595  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  31.13 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  30.06 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  34.46 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  34.46 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  34.46 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  29.19 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  28.1 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  30.72 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  33.77 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  26.5 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  43.82 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  29.33 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  35.87 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  30.2 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  40.17 
 
 		 269 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  39.56 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  33.33 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  40.91 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  29.03 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  31.15 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  45 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  40.54 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  40.54 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  40.54 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  25.81 
 
 		 264 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  37.78 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  32.21 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  32.21 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  39.44 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  32.03 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  38.04 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  31.94 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  29.22 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  28.84 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  33.33 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.08 
 
 		 1888 aa  56.2  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  36.05 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1133  TonB family protein  35.26 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  34.09 
 
 		 269 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  23.03 
 
 		 269 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  23.69 
 
 		 268 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  35.62 
 
 		 250 aa  53.1  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  24.83 
 
 		 268 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  28.34 
 
 		 248 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3695  TonB family protein  26.74 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1146  TonB family protein  30.83 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.167411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  34.67 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  31.46 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1256  TonB family protein  35.37 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  31.46 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  34.07 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  31.91 
 
 		 266 aa  50.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  25.77 
 
 		 2449 aa  50.1  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  29.46 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  30.21 
 
 		 354 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  29.1 
 
 		 171 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  33.33 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1668  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  25.48 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1487  TonB family protein  38.67 
 
 		 386 aa  47  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.39629 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  30.97 
 
 		 1088 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  31.52 
 
 		 495 aa  46.6  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  24.72 
 
 		 246 aa  46.2  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  28.97 
 
 		 239 aa  46.2  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  48.98 
 
 		 88 aa  46.2  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  48.08 
 
 		 164 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  40.62 
 
 		 308 aa  45.8  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  48.08 
 
 		 202 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  30.05 
 
 		 242 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0922  putative TonB protein  28.41 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.702209  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  30.05 
 
 		 242 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  48.78 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3167  protein TolA  28.09 
 
 		 331 aa  43.5  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  32.5 
 
 		 235 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1620  TonB family protein  28.89 
 
 		 394 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.381372 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1614  TonB protein  34.57 
 
 		 283 aa  42.7  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  34.67 
 
 		 250 aa  42.7  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  27.57 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  33.33 
 
 		 300 aa  42.4  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>