34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0138 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  100 
 
 		 354 aa  702    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2854  TonB family protein  45.92 
 
 		 341 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  32.66 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  33.33 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  33.75 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  35.96 
 
 		 411 aa  57  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  29.3 
 
 		 324 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  26.25 
 
 		 1088 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  28.57 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  38.03 
 
 		 219 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  35.44 
 
 		 292 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  33.33 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  36.99 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  26.35 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2407  TonB family protein  47.73 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  34.52 
 
 		 248 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0852  TonB family protein  37.1 
 
 		 167 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0992  TonB family protein  45.45 
 
 		 163 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0403121  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0513  TonB-like  45.45 
 
 		 163 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0952  TonB family protein  45.45 
 
 		 163 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  30.26 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0864  TonB family protein  43.18 
 
 		 142 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  30.26 
 
 		 267 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  28.21 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  28.57 
 
 		 264 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  30.26 
 
 		 267 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  28.57 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  33.33 
 
 		 248 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  29.87 
 
 		 268 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  36.21 
 
 		 248 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  32.05 
 
 		 289 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  28.42 
 
 		 268 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  33.33 
 
 		 315 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  33.33 
 
 		 237 aa  43.1  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>