47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2127 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  100 
 
 		 330 aa  624  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0352  TonB-like  37.38 
 
 		 304 aa  106  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  33.76 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  34.86 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  39.68 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  42.7 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  33 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3015  TonB family protein  33.01 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  41.18 
 
 		 88 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  31.25 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  38.55 
 
 		 411 aa  53.9  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0922  putative TonB protein  37.8 
 
 		 294 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.702209  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2581  TonB family protein  34.31 
 
 		 294 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.632604  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  30.26 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  37.89 
 
 		 250 aa  51.2  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  32.69 
 
 		 263 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  29.1 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2854  TonB family protein  35.29 
 
 		 341 aa  49.7  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  44.44 
 
 		 285 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  36.96 
 
 		 291 aa  49.7  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  37.23 
 
 		 294 aa  49.3  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  38.96 
 
 		 347 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  30.95 
 
 		 256 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  38.46 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  27.57 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  37.33 
 
 		 239 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  37.29 
 
 		 277 aa  46.6  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  31.82 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  31.82 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  64.52 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  27.31 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  37.66 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0017  TonB-like  35 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  31.51 
 
 		 248 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  33.33 
 
 		 219 aa  43.5  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  21.46 
 
 		 248 aa  43.5  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  40.98 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  27.88 
 
 		 248 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  37.5 
 
 		 154 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  25.19 
 
 		 264 aa  43.1  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  31.25 
 
 		 220 aa  43.1  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  31.91 
 
 		 266 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  31.03 
 
 		 269 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  37.78 
 
 		 250 aa  42.7  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  44.64 
 
 		 263 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2528  TonB family protein  29.41 
 
 		 393 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  38.18 
 
 		 286 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>