59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0760 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  100 
 
 
344 aa  678    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2586  protein TolA  55.43 
 
 
350 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807612  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  56 
 
 
351 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  55.71 
 
 
351 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  55.71 
 
 
351 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  54.57 
 
 
351 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0695  protein TolA  54.93 
 
 
355 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337402  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0678  TolA family protein  54.93 
 
 
355 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  52.79 
 
 
334 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  91.94 
 
 
347 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  77.78 
 
 
351 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  36.01 
 
 
342 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  36.21 
 
 
342 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  34.24 
 
 
351 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  58.62 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  65.56 
 
 
341 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  65.56 
 
 
341 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  65.56 
 
 
341 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  65.56 
 
 
341 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  65.56 
 
 
341 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  65.56 
 
 
341 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  65.56 
 
 
341 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  33.43 
 
 
296 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  28.57 
 
 
317 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  28 
 
 
337 aa  97.4  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  30.27 
 
 
282 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  37.71 
 
 
253 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  43.48 
 
 
323 aa  89  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  43.48 
 
 
323 aa  89  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2461  protein TolA  48.19 
 
 
380 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216675  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  34.43 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2943  protein TolA  39.45 
 
 
338 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  37.29 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  38.82 
 
 
283 aa  61.6  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  44.16 
 
 
275 aa  60.1  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  27.62 
 
 
925 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  39.64 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  48.28 
 
 
421 aa  53.1  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  26.87 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  30.19 
 
 
290 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0948  protein TolA  26.59 
 
 
346 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.929529  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  25.81 
 
 
253 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  42.42 
 
 
278 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0243  TonB family protein  33.33 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  29.6 
 
 
317 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  36.63 
 
 
3242 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  37.66 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1228  TolA protein, putative  34.33 
 
 
467 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  35.16 
 
 
451 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  33.72 
 
 
507 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  33.09 
 
 
526 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  24.32 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.09 
 
 
526 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  33.09 
 
 
524 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  33.09 
 
 
524 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  33.09 
 
 
524 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.09 
 
 
524 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.09 
 
 
526 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  34.94 
 
 
441 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>