67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3919 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  100 
 
 		 347 aa  682    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  79.25 
 
 		 344 aa  331  9e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2586  protein TolA  52.75 
 
 		 350 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  51.4 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  51.12 
 
 		 351 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  51.12 
 
 		 351 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  49.44 
 
 		 351 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0695  protein TolA  50.97 
 
 		 355 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0678  TolA family protein  50.97 
 
 		 355 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  35.82 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  72.66 
 
 		 351 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  36.49 
 
 		 342 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  41.45 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  35.08 
 
 		 351 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  64.71 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  63.33 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  63.33 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  63.33 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  63.33 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  63.33 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  63.33 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  63.33 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  37.2 
 
 		 345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  29.79 
 
 		 282 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  30.65 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  28.8 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  28.8 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  35.86 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  43.8 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  43.8 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  46.51 
 
 		 253 aa  89.7  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2461  protein TolA  48.19 
 
 		 380 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2943  protein TolA  40.62 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  38.12 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  37.37 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  43.04 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  27.49 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  25.61 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  28.8 
 
 		 925 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  40.68 
 
 		 278 aa  53.1  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  45 
 
 		 421 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  38.96 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.33 
 
 		 524 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  33.33 
 
 		 524 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  33.33 
 
 		 526 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.33 
 
 		 526 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  33.33 
 
 		 524 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  33.33 
 
 		 524 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  28.46 
 
 		 3242 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.33 
 
 		 526 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  26.62 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  33.33 
 
 		 524 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  32.21 
 
 		 524 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  32.21 
 
 		 524 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  33.33 
 
 		 519 aa  46.6  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  24.73 
 
 		 346 aa  46.2  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  27.17 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  38.53 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  35.11 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  26.29 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  33.73 
 
 		 441 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0948  protein TolA  24.45 
 
 		 346 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.929529  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  30.94 
 
 		 1163 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  22.43 
 
 		 3078 aa  43.5  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.72 
 
 		 1155 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  30.14 
 
 		 271 aa  43.5  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1712  hypothetical protein  24.86 
 
 		 280 aa  42.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0852036  hitchhiker  0.00264543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>