63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_2019c on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  100 
 
 
271 aa  532  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  98.53 
 
 
273 aa  484  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  37.55 
 
 
332 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  37.55 
 
 
332 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  31.08 
 
 
298 aa  94.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  34.4 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  28.79 
 
 
253 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  33.53 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  37.62 
 
 
341 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  31.31 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  32.75 
 
 
290 aa  67  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  34.65 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  34.65 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  34.65 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2230  TonB family protein  36.78 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2532  TolA family protein  34.65 
 
 
340 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000043804  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2441  TolA family protein  34.65 
 
 
340 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000397376  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1228  TolA protein, putative  31.25 
 
 
467 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0726  TolA family protein  37.9 
 
 
304 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0649134  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0535  protein TolA  38.55 
 
 
345 aa  64.3  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000935471  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2369  TolA family protein  33.66 
 
 
340 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000264795  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2749  tolA protein  33.66 
 
 
345 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  35.11 
 
 
342 aa  62.4  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  31.03 
 
 
311 aa  62.4  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1526  TolA family protein  32.76 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124316  normal  0.623667 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  28.52 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  32.38 
 
 
319 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2087  hypothetical protein  33.33 
 
 
327 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0948  protein TolA  28.24 
 
 
346 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.929529  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2340  hypothetical protein  33.85 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00623137  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1852  TonB-like protein  29.32 
 
 
366 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1276  TonB family protein  30.72 
 
 
326 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274487  normal  0.431648 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2732  protein TolA  28.45 
 
 
309 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00666488  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  29.81 
 
 
341 aa  56.2  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36650  TolA protein  33.33 
 
 
452 aa  55.8  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2216  TonB domain-containing protein  32.09 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0243  TonB family protein  31.03 
 
 
333 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  28.38 
 
 
329 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  30.23 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4197  protein TolA  29.03 
 
 
372 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  26.03 
 
 
318 aa  53.1  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1250  Tol-Pal system, TolA  29.03 
 
 
372 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202899  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1221  biopolymer transport protein TolA  28.39 
 
 
372 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.882269  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  30.56 
 
 
335 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3631  TonB-like  29.29 
 
 
332 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.653756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51730  TolA protein  32 
 
 
347 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000424658  decreased coverage  0.00000451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4537  TolA protein  32 
 
 
345 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  32.97 
 
 
278 aa  49.3  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3994  protein TolA  27.74 
 
 
358 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.513554  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1414  TonB, C-terminal  34.57 
 
 
356 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170707  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3973  tolA protein  34.57 
 
 
356 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0266991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4403  TonB-like  34.57 
 
 
359 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176341  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01563  protein TolA  29.86 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.479302  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  38.03 
 
 
275 aa  47  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2211  TonB family protein  30.43 
 
 
274 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000585223  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2049  colicin uptake-like protein  32.58 
 
 
146 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  34.33 
 
 
253 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0565  protein TolA  25.32 
 
 
337 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.370108  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1155  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  33.33 
 
 
389 aa  42.7  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  30.14 
 
 
351 aa  42  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  32.81 
 
 
351 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  32.81 
 
 
351 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  32.81 
 
 
351 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>