50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3240 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  100 
 
 
341 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  99.71 
 
 
341 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  669    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  100 
 
 
341 aa  669    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  100 
 
 
341 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  100 
 
 
341 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  100 
 
 
341 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  85.92 
 
 
334 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2586  protein TolA  69.86 
 
 
350 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807612  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  70.23 
 
 
351 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  69.94 
 
 
351 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  69.94 
 
 
351 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  70.23 
 
 
351 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0695  protein TolA  67.05 
 
 
355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337402  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0678  TolA family protein  67.34 
 
 
355 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  41.48 
 
 
360 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  61.9 
 
 
351 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  64.15 
 
 
347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  35.21 
 
 
296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  32.1 
 
 
351 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  64.84 
 
 
344 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  38.4 
 
 
345 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  29.6 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  30.98 
 
 
282 aa  95.5  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  55.95 
 
 
253 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  30.12 
 
 
337 aa  93.6  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  48.98 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  48.98 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  41.32 
 
 
421 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  50.89 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  43.53 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  33.7 
 
 
323 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  33.7 
 
 
323 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0587  TonB family protein  30.13 
 
 
324 aa  56.6  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  30.37 
 
 
925 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3631  TonB-like  28.78 
 
 
332 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.653756  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  38.64 
 
 
275 aa  52  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3117  protein TolA  28 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  35.96 
 
 
278 aa  50.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  32.8 
 
 
3242 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  27.31 
 
 
273 aa  46.2  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  30.37 
 
 
290 aa  46.2  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  24.85 
 
 
342 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1228  TolA protein, putative  28.4 
 
 
467 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  36.36 
 
 
263 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  27.92 
 
 
271 aa  42.7  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  29.32 
 
 
3392 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  31 
 
 
1163 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  49.02 
 
 
317 aa  42.7  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>