58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2773 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  100 
 
 		 323 aa  627  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  100 
 
 		 323 aa  627  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  64.51 
 
 		 351 aa  345  8e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  54.18 
 
 		 302 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  49.26 
 
 		 337 aa  235  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  48.77 
 
 		 317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  46.75 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  43.21 
 
 		 282 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2461  protein TolA  46.98 
 
 		 380 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  59.82 
 
 		 421 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2943  protein TolA  52.07 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  45.39 
 
 		 342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  44.68 
 
 		 342 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  32.7 
 
 		 253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  33.7 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  50.59 
 
 		 378 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  48.24 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  39.68 
 
 		 351 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  41.73 
 
 		 347 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  48.19 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  43.62 
 
 		 441 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  47.13 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  40.24 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  40.24 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  40.24 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  40.24 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  35.23 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3120  protein TolA  29.07 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  31.75 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  31.75 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  31.75 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  31.75 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  31.75 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  31.75 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  31.75 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  35.43 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  37.21 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0678  TolA family protein  40.66 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3323  protein TolA  30.86 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.672074 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0695  protein TolA  40.56 
 
 		 355 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3117  protein TolA  59.09 
 
 		 309 aa  52.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  23.62 
 
 		 346 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  35.48 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  29.91 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0948  protein TolA  24.1 
 
 		 346 aa  49.7  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.929529  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2586  protein TolA  38.34 
 
 		 350 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2340  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00623137  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1444  hypothetical protein  38.2 
 
 		 857 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  30.46 
 
 		 581 aa  46.2  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2715  TonB-like  40.91 
 
 		 353 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0316774  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  29.36 
 
 		 324 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36650  TolA protein  29.31 
 
 		 452 aa  43.5  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  44.19 
 
 		 276 aa  43.5  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  30.65 
 
 		 332 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01563  protein TolA  23.55 
 
 		 322 aa  42.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.479302  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3033  TonB family protein  33.72 
 
 		 528 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3088  TonB family protein  33.72 
 
 		 528 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0726849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2211  TonB family protein  27.06 
 
 		 274 aa  42.4  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000585223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>