23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3033 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3088  TonB family protein  99.62 
 
 
528 aa  1015    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0726849  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3033  TonB family protein  100 
 
 
528 aa  1018    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  53.33 
 
 
925 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  31.58 
 
 
443 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29.15 
 
 
2449 aa  63.2  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0816  hypothetical protein  60.94 
 
 
373 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00128516  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2390  TonB family protein  42.31 
 
 
474 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.600506 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0756  putative ribosomal protein L5-like protein  57.89 
 
 
359 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0450943  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0720  hypothetical protein  56.14 
 
 
359 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43680  predicted protein  44.32 
 
 
1458 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.16765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  30.46 
 
 
3242 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  35.09 
 
 
507 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04270  Actin cytoskeleton-regulatory complex protein pan1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5B0]  37.17 
 
 
1484 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.441373  normal  0.020853 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49618  predicted protein  32.67 
 
 
958 aa  48.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4616  hypothetical protein  56.82 
 
 
345 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00528758  normal  0.0377754 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  45.83 
 
 
295 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0603  hypothetical protein  46.48 
 
 
373 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0807218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0339  TonB family protein  32.29 
 
 
597 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  54 
 
 
287 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  39.56 
 
 
792 aa  45.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  45.45 
 
 
287 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  43.88 
 
 
330 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  39.73 
 
 
651 aa  43.9  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>