54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2454 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  100 
 
 		 351 aa  687    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  53.12 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2586  protein TolA  51.98 
 
 		 350 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  52.84 
 
 		 351 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  52.84 
 
 		 351 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  52.54 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0695  protein TolA  54.73 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0678  TolA family protein  54.73 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  54.81 
 
 		 334 aa  235  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  53.64 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  53.64 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  53.64 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  53.64 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  53.64 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  53.64 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  53.64 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  76.61 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  44.23 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  39.78 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  38.89 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  75.59 
 
 		 347 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  35.14 
 
 		 351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  30.26 
 
 		 253 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  29.64 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  30.57 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  31.33 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  30.59 
 
 		 282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  31.08 
 
 		 296 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  36.87 
 
 		 345 aa  95.9  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  40 
 
 		 323 aa  89.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  40 
 
 		 323 aa  89.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  47.66 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  41.38 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  35.29 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  27.51 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  47.06 
 
 		 421 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  28.41 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  39.39 
 
 		 290 aa  50.8  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  27.94 
 
 		 332 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  40.3 
 
 		 278 aa  50.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  34.94 
 
 		 441 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  25.91 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  31.16 
 
 		 925 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  36.36 
 
 		 263 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  26.11 
 
 		 264 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  33.33 
 
 		 3242 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0948  protein TolA  27.2 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.929529  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  25.89 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0587  TonB family protein  25.58 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  40 
 
 		 264 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  39.51 
 
 		 245 aa  43.9  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  29.92 
 
 		 317 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  30.14 
 
 		 273 aa  43.1  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  30.14 
 
 		 271 aa  43.1  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>