51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2225 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  100 
 
 		 351 aa  681    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  50.56 
 
 		 302 aa  275  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  46.05 
 
 		 337 aa  215  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  45.48 
 
 		 317 aa  209  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  41.71 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2461  protein TolA  46.3 
 
 		 380 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  35.07 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  55.86 
 
 		 421 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  32.68 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  44.44 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2943  protein TolA  48.36 
 
 		 338 aa  113  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  33.9 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  25.44 
 
 		 253 aa  97.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  47.06 
 
 		 378 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  34.16 
 
 		 345 aa  89.7  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  82.26 
 
 		 323 aa  89.4  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  82.26 
 
 		 323 aa  89.4  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  31.68 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  31.68 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  32.1 
 
 		 341 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  31.68 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  31.68 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  31.68 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  31.68 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  40 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2586  protein TolA  36.08 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  41.38 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  39.56 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  41.38 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  37.23 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  37.31 
 
 		 278 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  33.96 
 
 		 581 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49618  predicted protein  36.59 
 
 		 958 aa  50.1  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3323  protein TolA  29.07 
 
 		 306 aa  49.3  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.672074 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2211  TonB family protein  29.41 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000585223  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  29.46 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  37.04 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  37.04 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  30.77 
 
 		 3242 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  37.04 
 
 		 351 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  36.45 
 
 		 794 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  27.5 
 
 		 332 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  44.68 
 
 		 276 aa  46.6  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  25.56 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0678  TolA family protein  45.61 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  25.68 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  48.08 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  23.88 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2715  TonB-like  41.67 
 
 		 353 aa  44.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0316774  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0695  protein TolA  45.61 
 
 		 355 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3117  protein TolA  52.24 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>