47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1374 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  100 
 
 
334 aa  658    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  92.38 
 
 
341 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  92.38 
 
 
341 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  92.38 
 
 
341 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  92.08 
 
 
341 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  92.38 
 
 
341 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  92.38 
 
 
341 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  92.38 
 
 
341 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2586  protein TolA  69.23 
 
 
350 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807612  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  70.72 
 
 
351 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  70.43 
 
 
351 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  70.43 
 
 
351 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  69.23 
 
 
351 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0695  protein TolA  64.99 
 
 
355 aa  309  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337402  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0678  TolA family protein  64.99 
 
 
355 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  40.93 
 
 
360 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  33.89 
 
 
342 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  62.7 
 
 
351 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  32.82 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  65.09 
 
 
347 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  56.91 
 
 
344 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  35.65 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  33.78 
 
 
351 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  35.75 
 
 
345 aa  106  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  30.39 
 
 
302 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  28.62 
 
 
317 aa  99.8  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  27.36 
 
 
337 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  30.41 
 
 
282 aa  93.6  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  48.54 
 
 
342 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  40.5 
 
 
421 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  51.28 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  42.11 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  35.11 
 
 
323 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  35.11 
 
 
323 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3631  TonB-like  28.77 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.653756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  30.43 
 
 
925 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0587  TonB family protein  31.82 
 
 
324 aa  53.9  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  38.64 
 
 
275 aa  52.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  35.96 
 
 
278 aa  50.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  29.29 
 
 
1163 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  31.16 
 
 
3242 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1228  TolA protein, putative  28.4 
 
 
467 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  28.57 
 
 
3392 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  26.96 
 
 
273 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  35.16 
 
 
538 aa  43.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  27.59 
 
 
294 aa  43.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  36.36 
 
 
263 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>