54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2676 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  100 
 
 		 360 aa  704    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  63.66 
 
 		 378 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  46.24 
 
 		 342 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  44.23 
 
 		 342 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  41.28 
 
 		 253 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0678  TolA family protein  46.13 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0695  protein TolA  45.85 
 
 		 355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337402  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  44.38 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  33.74 
 
 		 337 aa  146  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  34.04 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  55.2 
 
 		 351 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  32.94 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  35.01 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  34.06 
 
 		 296 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  34.47 
 
 		 351 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  48.28 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  51.3 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  55.81 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  55.81 
 
 		 351 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  55.81 
 
 		 351 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  55.81 
 
 		 351 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  48.36 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  48.36 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  48.36 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  48.36 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  48.36 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  48.36 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  48.36 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2943  protein TolA  42.74 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2586  protein TolA  55.05 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  42.2 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  42.2 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2461  protein TolA  48.24 
 
 		 380 aa  96.3  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  55.56 
 
 		 334 aa  95.9  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  50 
 
 		 347 aa  96.3  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3117  protein TolA  40 
 
 		 309 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  45.71 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  38.46 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  39.29 
 
 		 441 aa  67  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0261  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  32.31 
 
 		 351 aa  62  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00647443  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  37.08 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  37.66 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  32.63 
 
 		 275 aa  50.4  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2211  TonB family protein  30.59 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000585223  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  29.91 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  40.3 
 
 		 277 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  23.61 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  23.88 
 
 		 3242 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  27.58 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  36.36 
 
 		 451 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0469  TonB family protein  26.67 
 
 		 335 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  30.56 
 
 		 264 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  33.83 
 
 		 264 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1228  TolA protein, putative  31.82 
 
 		 467 aa  43.1  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>