39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2461 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2461  protein TolA  100 
 
 		 380 aa  728    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  46.34 
 
 		 351 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  39.47 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  36.43 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  34.88 
 
 		 317 aa  146  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  37.11 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  55 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  44.62 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  32.98 
 
 		 342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  33.96 
 
 		 342 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2943  protein TolA  48.39 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3117  protein TolA  39.87 
 
 		 309 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  41.18 
 
 		 253 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  48.86 
 
 		 360 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  50.59 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  44.88 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  44.88 
 
 		 347 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  46.55 
 
 		 344 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  44.58 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  43.33 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  45.45 
 
 		 283 aa  75.9  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  41.3 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  43.18 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  31.61 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  37.5 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  34.29 
 
 		 320 aa  57  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3323  protein TolA  31.48 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.672074 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  41.79 
 
 		 276 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  26.88 
 
 		 332 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  32.66 
 
 		 581 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  30.74 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  27.27 
 
 		 253 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1852  TonB-like protein  37.1 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  26.41 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  29.56 
 
 		 319 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  28.18 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  50.88 
 
 		 323 aa  43.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3120  protein TolA  27.27 
 
 		 351 aa  43.1  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  50.88 
 
 		 323 aa  43.1  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>