12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3120 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3120  protein TolA  100 
 
 		 351 aa  691    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01563  protein TolA  69.02 
 
 		 322 aa  362  4e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.479302  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  49.72 
 
 		 346 aa  312  5.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0948  protein TolA  49.44 
 
 		 346 aa  310  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.929529  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  24.65 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  29.56 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  29.35 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  35.71 
 
 		 421 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1228  TolA protein, putative  35.44 
 
 		 467 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  42.05 
 
 		 507 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  33.53 
 
 		 282 aa  43.1  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  22.64 
 
 		 3242 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>