More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1223 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  100 
 
 
507 aa  1002    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  95.06 
 
 
507 aa  858    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3314  band 7 protein  65.06 
 
 
495 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018778  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.65 
 
 
526 aa  598  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  62.84 
 
 
524 aa  599  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  62.84 
 
 
524 aa  599  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  62.84 
 
 
526 aa  598  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.65 
 
 
526 aa  598  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  62.84 
 
 
524 aa  599  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  62.65 
 
 
524 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.84 
 
 
524 aa  598  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  63.2 
 
 
519 aa  594  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  61.52 
 
 
524 aa  591  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  61.67 
 
 
524 aa  590  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  48.07 
 
 
537 aa  402  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  44.15 
 
 
475 aa  363  3e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  42 
 
 
509 aa  302  9e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0782  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  43.45 
 
 
503 aa  293  4e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1402  flotillin  38.16 
 
 
489 aa  289  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0725365  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2091  band 7 protein  32.36 
 
 
516 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0367  hypothetical protein  33.83 
 
 
499 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1912  band 7 protein  31.88 
 
 
492 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5091  band 7 protein  34.88 
 
 
459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000550559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  32.5 
 
 
477 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2104  band 7 protein  36.14 
 
 
513 aa  197  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0712  band 7 protein  33.33 
 
 
496 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.350479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8817  band 7 protein  32.17 
 
 
518 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.209913  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0812  band 7 protein  29.16 
 
 
468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1727  band 7 protein  36.64 
 
 
472 aa  179  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000752152  normal  0.0958573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2287  band 7 protein  30.85 
 
 
467 aa  174  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338349  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  29.2 
 
 
507 aa  168  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1073  band 7 protein  32.64 
 
 
477 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.532983  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  31.33 
 
 
482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1761  band 7 protein  31.96 
 
 
480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000813907 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01370  hypothetical protein  31.16 
 
 
490 aa  160  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0503  band 7 protein  33.33 
 
 
370 aa  153  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00953758  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  29.51 
 
 
504 aa  153  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1398  Band 7 protein  26.68 
 
 
422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267003  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0445  band 7 protein  27.01 
 
 
538 aa  149  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116716  normal  0.17273 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0313  band 7 protein  29.11 
 
 
423 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  31.06 
 
 
500 aa  142  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0946  band 7 protein  27.24 
 
 
430 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0402  band 7 protein  32.82 
 
 
473 aa  133  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2498  Band 7 protein  31.61 
 
 
414 aa  133  9e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.115439  hitchhiker  0.00327007 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0403  band 7 protein  27.74 
 
 
430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8346  band 7 protein  32.46 
 
 
383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3175  band 7 protein  29.14 
 
 
421 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  26.89 
 
 
519 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2921  band 7 protein  28.92 
 
 
421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2499  Band 7 protein  29.34 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0504738  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0132  band 7 protein  29.34 
 
 
491 aa  126  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1144  band 7 protein  27.51 
 
 
473 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.401105  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0314  band 7 protein  26.44 
 
 
460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0945  band 7 protein  27.33 
 
 
451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2920  band 7 protein  28.2 
 
 
450 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3176  band 7 protein  28.2 
 
 
450 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.689378 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  27.47 
 
 
553 aa  107  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05180  hypothetical protein  28.35 
 
 
499 aa  106  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.29 
 
 
553 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1397  Band 7 protein  28.92 
 
 
447 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.936063 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1084  band 7 protein  28.41 
 
 
604 aa  103  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3109  band 7 protein  28.05 
 
 
592 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3252  band 7 protein  28.05 
 
 
592 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  28.05 
 
 
592 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1267  band 7 protein  28.05 
 
 
592 aa  103  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1377  hypothetical protein  27.51 
 
 
592 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  26.93 
 
 
553 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  27.22 
 
 
542 aa  101  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  26.93 
 
 
549 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2816  band 7 protein  27.26 
 
 
592 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2899  band 7 protein  27.26 
 
 
592 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  26.93 
 
 
553 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  26.85 
 
 
553 aa  100  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  28.68 
 
 
562 aa  100  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2996  band 7 protein  27.41 
 
 
592 aa  99  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1186  band 7 protein  27.32 
 
 
590 aa  99.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.24 
 
 
553 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3622  band 7 protein  26.54 
 
 
587 aa  96.3  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0804  hypothetical protein  26.85 
 
 
585 aa  95.5  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01973  band 7 protein  26.19 
 
 
589 aa  93.6  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0247971  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1794  band 7 protein  25.8 
 
 
560 aa  89.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511769  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3388  inner membrane protein YqiK  25.91 
 
 
559 aa  86.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4673  band 7 protein  29.41 
 
 
560 aa  86.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.122447  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  25.91 
 
 
559 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  25.91 
 
 
559 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3554  inner membrane protein YqiK  25.54 
 
 
559 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0946  band 7 protein  27.26 
 
 
595 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  25.91 
 
 
559 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0005  band 7 protein  27.3 
 
 
569 aa  78.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0238234  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3146  band 7 protein  27.04 
 
 
585 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2218  hypothetical protein  30.03 
 
 
558 aa  76.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3022  band 7 protein  26.92 
 
 
570 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2882  band 7 protein  27.05 
 
 
587 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.107759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0682  band 7 protein  27.57 
 
 
568 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0118281 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  29.86 
 
 
332 aa  72  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1413  band 7 protein  26.38 
 
 
744 aa  70.1  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  24.59 
 
 
331 aa  67  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  28.5 
 
 
329 aa  66.6  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  27.09 
 
 
344 aa  66.6  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2735  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.4 
 
 
319 aa  65.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>