40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1228 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1228  TolA protein, putative  100 
 
 		 467 aa  816    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  45.6 
 
 		 318 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  37.84 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  37.84 
 
 		 332 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  35.9 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  40.54 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  40.54 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1221  biopolymer transport protein TolA  32.28 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.882269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2216  TonB domain-containing protein  38.46 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1852  TonB-like protein  37.07 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1250  Tol-Pal system, TolA  32.28 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4197  protein TolA  32.28 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  35 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3994  protein TolA  35.07 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.513554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf584  virulence-associated lipoprotein MIA  29.03 
 
 		 255 aa  56.2  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0652484  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  45.65 
 
 		 290 aa  49.3  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3120  protein TolA  34.15 
 
 		 351 aa  49.3  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  36.23 
 
 		 278 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  28.06 
 
 		 737 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  34.85 
 
 		 378 aa  46.6  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  28.4 
 
 		 334 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  35.44 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  37.31 
 
 		 2196 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  28.4 
 
 		 341 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  51.35 
 
 		 990 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  28.4 
 
 		 341 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  28.4 
 
 		 341 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  28.4 
 
 		 341 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  28.4 
 
 		 341 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0243  TonB family protein  28.76 
 
 		 333 aa  45.8  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  28.4 
 
 		 341 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  28.4 
 
 		 341 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  51.35 
 
 		 959 aa  45.8  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.3 
 
 		 561 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 964 aa  45.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  31.65 
 
 		 344 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31113  predicted protein  34.34 
 
 		 1345 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  33.87 
 
 		 296 aa  44.3  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.42 
 
 		 491 aa  43.1  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  38.1 
 
 		 901 aa  43.5  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>