63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4054 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  100 
 
 		 278 aa  523  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  63.22 
 
 		 320 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  27.86 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  48 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  45.71 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  33.33 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  45.21 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  47.14 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  27.39 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  37.93 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3117  protein TolA  35.64 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0535  protein TolA  36.08 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000935471  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2461  protein TolA  38.2 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  28.21 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  28.95 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0243  TonB family protein  32.41 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  38.37 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  38.37 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2230  TonB family protein  35.71 
 
 		 308 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2340  hypothetical protein  37.25 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00623137  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  32.43 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  36.11 
 
 		 421 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1228  TolA protein, putative  32.41 
 
 		 467 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  33.33 
 
 		 337 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  33.75 
 
 		 253 aa  52.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2715  TonB-like  50 
 
 		 353 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0316774  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  33.33 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  44.83 
 
 		 351 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  34.91 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0678  TolA family protein  46.81 
 
 		 355 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  44.83 
 
 		 351 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  35.96 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  47.73 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  35.96 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  35.96 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  35.96 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  35.96 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  35.96 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  47.73 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  35.96 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0695  protein TolA  47.73 
 
 		 355 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  35.71 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  40.3 
 
 		 351 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  35.96 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  38.67 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  42.55 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2586  protein TolA  46.81 
 
 		 350 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  35.53 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  38.67 
 
 		 332 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  28.57 
 
 		 292 aa  49.3  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  40 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  36 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  36 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  34.12 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  35.45 
 
 		 2449 aa  46.2  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  35.33 
 
 		 292 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  24.21 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4757  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  33.67 
 
 		 1081 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  28.18 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2211  TonB family protein  30.3 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000585223  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0943  adhesion exoprotein  45.45 
 
 		 979 aa  42.7  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1852  TonB-like protein  24.22 
 
 		 366 aa  42.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  42.11 
 
 		 497 aa  42  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>