30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0535 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0535  protein TolA  100 
 
 		 345 aa  643    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000935471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01563  protein TolA  44.44 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.479302  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  30.87 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  30.87 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0948  protein TolA  27.51 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.929529  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  27.08 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  28.08 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  32 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  33.71 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2230  TonB family protein  41.46 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  33.33 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3120  protein TolA  30.74 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2216  TonB domain-containing protein  36.9 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  36.46 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  39.02 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  25.51 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  34.62 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  28.4 
 
 		 328 aa  53.5  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  26.41 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0243  TonB family protein  32.97 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1852  TonB-like protein  30.51 
 
 		 366 aa  49.7  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  33.33 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  26.27 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  27.97 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  33.03 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  30.23 
 
 		 290 aa  45.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  33.98 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  33.98 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  33.98 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  33.98 
 
 		 341 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>