14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4757 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4757  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  100 
 
 		 1081 aa  2204    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1684  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  37.89 
 
 		 732 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.439248  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0746  hypothetical protein  46 
 
 		 465 aa  214  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0647  hypothetical protein  44.94 
 
 		 465 aa  212  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2665  hypothetical protein  41.85 
 
 		 488 aa  204  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2663  hypothetical protein  23.94 
 
 		 543 aa  93.2  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3728  hypothetical protein  26.47 
 
 		 475 aa  91.7  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2032  hypothetical protein  22.41 
 
 		 542 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2662  hypothetical protein  51.79 
 
 		 291 aa  67  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60438  highly conserved hypothetical protein  29.2 
 
 		 766 aa  66.2  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.11211  normal  0.0403806 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06268  DUF726 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12860)  30.81 
 
 		 873 aa  64.3  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2031  hypothetical protein  50.91 
 
 		 179 aa  63.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166729 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04028  DUF726 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03760)  30.05 
 
 		 1144 aa  57.4  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.421375 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01300  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1121 aa  53.5  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>