64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2715 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2715  TonB-like  100 
 
 		 353 aa  659    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0316774  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  35.55 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  50.63 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  52.7 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  37.25 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2340  hypothetical protein  43.14 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00623137  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  36.96 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  36.96 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  28.15 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  28.67 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  25.98 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  43.94 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  21.77 
 
 		 253 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  30.66 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  30.46 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  27.87 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  30.22 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  28.85 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  29.11 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  33.93 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  33.86 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  27.45 
 
 		 2066 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  27.45 
 
 		 2066 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  64.44 
 
 		 1229 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  27.78 
 
 		 293 aa  53.5  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  25.91 
 
 		 273 aa  53.1  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  40.91 
 
 		 421 aa  53.1  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3120  protein TolA  27.37 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0469  TonB family protein  30.85 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2943  protein TolA  48.48 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  26.24 
 
 		 271 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  23.62 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  29.24 
 
 		 329 aa  49.7  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  40.74 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  40.74 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  23.66 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  40.74 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2230  TonB family protein  39.74 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  34.01 
 
 		 925 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  23.84 
 
 		 2196 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0948  protein TolA  23.84 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.929529  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  26.52 
 
 		 304 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 657 aa  47  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  27.88 
 
 		 794 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  36 
 
 		 334 aa  46.6  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  38.46 
 
 		 283 aa  46.6  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  27.09 
 
 		 328 aa  46.2  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  30.95 
 
 		 891 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  36 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  36 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  36 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  36 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  36 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  36 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  36 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  27.27 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  37.78 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  20.54 
 
 		 3392 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43680  predicted protein  37 
 
 		 1458 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.16765  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  37.04 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  27.05 
 
 		 1557 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  25.5 
 
 		 298 aa  43.5  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.55 
 
 		 491 aa  43.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  27.17 
 
 		 341 aa  42.7  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>