85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0783 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  100 
 
 
320 aa  591  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  65.29 
 
 
926 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  58.14 
 
 
484 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  59.54 
 
 
489 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  61.98 
 
 
423 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  54.55 
 
 
630 aa  95.9  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  40.79 
 
 
444 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  48.11 
 
 
1261 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2715  TonB-like  52.38 
 
 
353 aa  72.4  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0316774  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  31.82 
 
 
1888 aa  67.4  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  40.32 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  33.09 
 
 
2449 aa  66.2  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  40.32 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  51.16 
 
 
501 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  34.33 
 
 
296 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  34.29 
 
 
928 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0535  protein TolA  33.71 
 
 
345 aa  62  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000935471  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  36.96 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  29.38 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  36.96 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  41.25 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  41.25 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  34.45 
 
 
2272 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  34.45 
 
 
2179 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  28.33 
 
 
602 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  38.66 
 
 
253 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  38.05 
 
 
897 aa  56.6  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  54.12 
 
 
278 aa  55.8  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  35 
 
 
342 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2340  hypothetical protein  38.26 
 
 
276 aa  55.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00623137  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  33.64 
 
 
317 aa  53.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2461  protein TolA  37.88 
 
 
380 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216675  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  40.91 
 
 
360 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  41.27 
 
 
378 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  31.78 
 
 
337 aa  53.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  43.01 
 
 
332 aa  53.1  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  33.65 
 
 
421 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  34.29 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  39.67 
 
 
268 aa  50.8  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  26.23 
 
 
267 aa  50.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  44.29 
 
 
345 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  28.69 
 
 
830 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  28.93 
 
 
292 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2230  TonB family protein  36.47 
 
 
308 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  36.15 
 
 
522 aa  49.7  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  37.01 
 
 
2313 aa  49.3  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  44.44 
 
 
5185 aa  49.3  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.27186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  42.48 
 
 
537 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  23.3 
 
 
346 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  37.7 
 
 
687 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1228  TolA protein, putative  34.92 
 
 
467 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0243  TonB family protein  33.33 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  34.62 
 
 
1088 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  41.38 
 
 
344 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3324  TonB family protein  27.12 
 
 
258 aa  46.2  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0714054  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2211  TonB family protein  29.55 
 
 
274 aa  45.8  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000585223  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0587  TonB family protein  29.02 
 
 
324 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  33.9 
 
 
453 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0948  protein TolA  24.71 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.929529  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  27.67 
 
 
451 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  50.74 
 
 
3409 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.46 
 
 
257 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  29.39 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  31.25 
 
 
271 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  30.23 
 
 
273 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2404  FHA domain-containing protein  34.87 
 
 
489 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210357  hitchhiker  0.0000326037 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  50 
 
 
1409 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  37.5 
 
 
351 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  37.5 
 
 
351 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1699  TonB-dependent receptor, putative  42.59 
 
 
237 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  37.5 
 
 
351 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  37.5 
 
 
351 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4375  NEAr transporter  26.58 
 
 
1147 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  29.03 
 
 
407 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00990  2-oxoglutarate metabolism-related protein, putative  40.96 
 
 
455 aa  43.1  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.906389  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  41.05 
 
 
436 aa  42.7  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  36 
 
 
264 aa  42.7  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  30.46 
 
 
242 aa  42.7  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1852  TonB-like protein  23.26 
 
 
366 aa  42.7  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  37.69 
 
 
2353 aa  42.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  30.46 
 
 
242 aa  42.7  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  31.88 
 
 
671 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  29.79 
 
 
300 aa  42.7  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2586  protein TolA  37.93 
 
 
350 aa  42.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807612  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>