36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2211 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2211  TonB family protein  100 
 
 		 274 aa  552  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000585223  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0858  Fis family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.487763  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0749  transcriptional regulator, Fis family  26.74 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0027337  normal  0.178173 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2162  transcriptional regulator, Fis family  29.49 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.111868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  28.85 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1909  hypothetical protein  25.34 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  34.95 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  34.95 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1712  hypothetical protein  32.12 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0852036  hitchhiker  0.00264543 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  24.54 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0746  TonB family protein  23.88 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000019388  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3631  TonB-like  27.95 
 
 		 332 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.653756  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  32.94 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  32.11 
 
 		 421 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  35.8 
 
 		 332 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  34.12 
 
 		 378 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  28.46 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0468  TonB family protein  28.57 
 
 		 420 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.662899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  27.21 
 
 		 320 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  29.52 
 
 		 351 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3324  TonB family protein  27.63 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0714054  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0243  TonB family protein  30.3 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0280  TonB domain-containing protein  32.88 
 
 		 341 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.256703  hitchhiker  0.000121849 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  34.57 
 
 		 332 aa  45.8  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  25 
 
 		 273 aa  45.4  0.0009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  35.82 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2976  putative TonB transport protein  26.49 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3323  protein TolA  28.28 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.672074 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1636  TonB-like  27.1 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.484992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  34.72 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2362  protein TolA  30.99 
 
 		 342 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.288809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0587  TonB family protein  27.55 
 
 		 324 aa  42.7  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  33.96 
 
 		 282 aa  42.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  29.36 
 
 		 324 aa  42  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  33.33 
 
 		 271 aa  42  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  29.63 
 
 		 318 aa  42  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>