59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0794 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  100 
 
 		 378 aa  734    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  66.84 
 
 		 360 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  47.2 
 
 		 342 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  47.97 
 
 		 345 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  60.42 
 
 		 253 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  33.43 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  31.99 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  36.65 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  45.68 
 
 		 296 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  37.44 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  46.22 
 
 		 421 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  37.66 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  56.07 
 
 		 342 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  44.35 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  44.35 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2461  protein TolA  52.56 
 
 		 380 aa  99.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  52.34 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  52.34 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  52.34 
 
 		 351 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2943  protein TolA  45.71 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2586  protein TolA  51.3 
 
 		 350 aa  94  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  51.69 
 
 		 275 aa  92.4  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  61.76 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  52.75 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  61.76 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  61.76 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  61.76 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  61.76 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  61.76 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  50.93 
 
 		 334 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  61.76 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0678  TolA family protein  44.37 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0695  protein TolA  44.37 
 
 		 355 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  51.35 
 
 		 351 aa  89.7  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3117  protein TolA  40.62 
 
 		 309 aa  89.4  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  66.04 
 
 		 351 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  61.4 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  62.96 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  43.21 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  36.78 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  37.93 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0261  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  33.72 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00647443  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2715  TonB-like  42.37 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0316774  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  37.66 
 
 		 320 aa  54.7  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  27.15 
 
 		 324 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  27.53 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2211  TonB family protein  35.9 
 
 		 274 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000585223  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0469  TonB family protein  27.8 
 
 		 335 aa  46.6  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  36.67 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  30.77 
 
 		 253 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.57 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1228  TolA protein, putative  34.85 
 
 		 467 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  23.82 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  29.33 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  40 
 
 		 310 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  31.25 
 
 		 325 aa  43.5  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  28 
 
 		 332 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  29.08 
 
 		 925 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3323  protein TolA  29.83 
 
 		 306 aa  42.7  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.672074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>