97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3765 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  100 
 
 
288 aa  583  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  44.8 
 
 
297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  44.06 
 
 
319 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  45.32 
 
 
298 aa  235  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  44.91 
 
 
300 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  40.69 
 
 
294 aa  230  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  43.88 
 
 
297 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  42.75 
 
 
300 aa  228  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  44.06 
 
 
301 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  44.44 
 
 
301 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  44.44 
 
 
301 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  42.09 
 
 
299 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  39.86 
 
 
286 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  42.31 
 
 
297 aa  192  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  40.14 
 
 
292 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  33.57 
 
 
291 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  33.57 
 
 
291 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  33.45 
 
 
307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  34.77 
 
 
291 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  32.86 
 
 
294 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  37.5 
 
 
294 aa  148  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  35.07 
 
 
310 aa  148  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  36.59 
 
 
288 aa  146  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  31.84 
 
 
323 aa  139  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  31.46 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  30.43 
 
 
316 aa  132  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  32.22 
 
 
300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  32.52 
 
 
295 aa  122  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  44.27 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  30.77 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  41.61 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  29.37 
 
 
304 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  29.37 
 
 
304 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  28.63 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  27.21 
 
 
328 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  28.52 
 
 
306 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  28.52 
 
 
296 aa  79  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  26.07 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  37.14 
 
 
295 aa  77  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  25 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  25.87 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  29.45 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1646  TonB family protein  27.72 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0972936  hitchhiker  0.00122452 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1978  TonB family protein  27.72 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  24.44 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  26.48 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  34.26 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  30.77 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  28.17 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  28.17 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2711  GETHR pentapeptide  34.04 
 
 
654 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.653885  hitchhiker  0.000850272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  26.92 
 
 
287 aa  63.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  38.64 
 
 
297 aa  62.8  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  23.76 
 
 
282 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  36.9 
 
 
292 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  37.97 
 
 
264 aa  55.8  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  33.75 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  36.78 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2668  TonB family protein  33.02 
 
 
252 aa  53.9  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2891  TonB family protein  33.72 
 
 
283 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  28.31 
 
 
235 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2313  hypothetical protein  28.26 
 
 
264 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8827  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  23.37 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2689  TonB family protein  28.26 
 
 
264 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  28.72 
 
 
274 aa  49.3  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2717  TonB family protein  33.33 
 
 
281 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  40.68 
 
 
150 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1624  TonB-like  25.81 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0946322  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  36.51 
 
 
285 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  30.26 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  31.37 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  36.51 
 
 
286 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  35.21 
 
 
202 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  35.21 
 
 
164 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0730  TonB-like  31.68 
 
 
225 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.210175  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  23.44 
 
 
256 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  37.1 
 
 
237 aa  46.2  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  35.06 
 
 
220 aa  46.2  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2895  TonB family protein  24.34 
 
 
236 aa  46.2  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  30.43 
 
 
261 aa  45.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  31.71 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  37.78 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  31.58 
 
 
244 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3297  TonB family protein  24.34 
 
 
230 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  29.59 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  36.67 
 
 
241 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  32.29 
 
 
324 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  27.5 
 
 
411 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1146  TonB family protein  36.51 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.167411  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  34.04 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  38.1 
 
 
257 aa  43.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  34.48 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  36.92 
 
 
315 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  31.4 
 
 
291 aa  42.7  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  40 
 
 
219 aa  42.7  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  40.82 
 
 
174 aa  42.7  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  28.75 
 
 
265 aa  42.4  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>