43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0144 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  100 
 
 		 318 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1228  TolA protein, putative  43.97 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  33.33 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  32.15 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1414  TonB, C-terminal  35.71 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  27.21 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3973  tolA protein  35.71 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0266991  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1221  biopolymer transport protein TolA  41.12 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.882269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  31.19 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  32.16 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  29.66 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  29.31 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  27.81 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  30.46 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51730  TolA protein  35.79 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000424658  decreased coverage  0.00000451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1852  TonB-like protein  42.11 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2216  TonB domain-containing protein  41.25 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0535  protein TolA  29.7 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000935471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36650  TolA protein  36.67 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0243  TonB family protein  31.78 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  34.29 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  31.74 
 
 		 2196 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  26.63 
 
 		 328 aa  57  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  30.34 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  23.86 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0948  protein TolA  23.58 
 
 		 346 aa  53.1  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.929529  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0469  TonB family protein  32.65 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  31.49 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  30.32 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0874  60S ribosomal protein L19  35.04 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  34.29 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  32.47 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  33.33 
 
 		 278 aa  49.7  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  33.82 
 
 		 651 aa  49.3  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0726  TolA family protein  36 
 
 		 304 aa  49.3  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0649134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0816  hypothetical protein  45.05 
 
 		 373 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00128516  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  41.13 
 
 		 925 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  34.31 
 
 		 356 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  26.33 
 
 		 320 aa  46.6  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  45 
 
 		 295 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  33.68 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  31.33 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3120  protein TolA  26.46 
 
 		 351 aa  42.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>