39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0726 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0726  TolA family protein  100 
 
 		 304 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0649134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  32.8 
 
 		 298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  33.23 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  31 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  32.72 
 
 		 329 aa  102  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2532  TolA family protein  40 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000043804  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2441  TolA family protein  40 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000397376  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  32.52 
 
 		 342 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  31.76 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2369  TolA family protein  39 
 
 		 340 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000264795  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2749  tolA protein  39 
 
 		 345 aa  96.3  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  40 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  40 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  39 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  35.29 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2732  protein TolA  38.61 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00666488  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2087  hypothetical protein  43.43 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  36.8 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1526  TolA family protein  38.38 
 
 		 311 aa  85.5  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124316  normal  0.623667 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  31.31 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  28.9 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  37.25 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  33.85 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  33.08 
 
 		 332 aa  72.4  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  29.67 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  38.22 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2340  hypothetical protein  39.13 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00623137  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  29.91 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2903  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  40 
 
 		 399 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  26.76 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3227  hypothetical protein  55.7 
 
 		 996 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.640032  normal  0.507723 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1155  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  38.27 
 
 		 389 aa  49.3  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  31.58 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  36.25 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2049  colicin uptake-like protein  30 
 
 		 146 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.89 
 
 		 453 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0936  hypothetical protein  42.73 
 
 		 801 aa  46.2  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1278  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  34.38 
 
 		 412 aa  42.7  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000166753  hitchhiker  0.0000389021 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01609  hypothetical protein  28.53 
 
 		 342 aa  42.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>