46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2087 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2087  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  622  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  59.88 
 
 		 328 aa  318  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  60.74 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  59.69 
 
 		 319 aa  299  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  61.86 
 
 		 311 aa  295  7e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  56.76 
 
 		 340 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  56.76 
 
 		 340 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  56.43 
 
 		 342 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  55.29 
 
 		 341 aa  278  6e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  62.8 
 
 		 329 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2532  TolA family protein  54.57 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000043804  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2441  TolA family protein  54.28 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000397376  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2369  TolA family protein  54.57 
 
 		 340 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000264795  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2749  tolA protein  53.2 
 
 		 345 aa  248  7e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2732  protein TolA  49.38 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00666488  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  40.06 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  43.38 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1526  TolA family protein  73.2 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124316  normal  0.623667 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  46.75 
 
 		 293 aa  125  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  33.74 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  32.88 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01609  hypothetical protein  34.01 
 
 		 342 aa  95.9  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0726  TolA family protein  43.43 
 
 		 304 aa  89.4  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0649134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003914  TolA protein  35.05 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0635795  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  34.13 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  34.13 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  31.55 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  28.99 
 
 		 271 aa  52.8  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2230  TonB family protein  31.18 
 
 		 308 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  39.07 
 
 		 925 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  30.32 
 
 		 273 aa  50.1  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  31.41 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0261  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  29.41 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00647443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2049  colicin uptake-like protein  32.18 
 
 		 146 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  33.66 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  29.69 
 
 		 2196 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  42.5 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  25.12 
 
 		 1682 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  41.67 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  33.9 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  66.67 
 
 		 914 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1248  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.83 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000169991  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  43.18 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  43.18 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  46.58 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  39.52 
 
 		 334 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>