36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2749 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2749  tolA protein  100 
 
 		 345 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  86.92 
 
 		 342 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  86.63 
 
 		 340 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  86.34 
 
 		 340 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2369  TolA family protein  93.33 
 
 		 340 aa  478  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000264795  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2441  TolA family protein  93.33 
 
 		 340 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000397376  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2532  TolA family protein  93.04 
 
 		 340 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000043804  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  83.48 
 
 		 341 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  84.1 
 
 		 329 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  61.16 
 
 		 319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  61.1 
 
 		 328 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  58.09 
 
 		 311 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  58.21 
 
 		 320 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  38.64 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2087  hypothetical protein  63.96 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1526  TolA family protein  61.4 
 
 		 311 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124316  normal  0.623667 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  37.42 
 
 		 304 aa  127  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  35.14 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  33.7 
 
 		 356 aa  122  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2732  protein TolA  64.14 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00666488  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  31.3 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003914  TolA protein  32.75 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0635795  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0726  TolA family protein  42.22 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0649134  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  35.31 
 
 		 332 aa  90.5  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  33.22 
 
 		 332 aa  86.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01609  hypothetical protein  33.64 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0768  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  37.93 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  32.12 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0261  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  31.17 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00647443  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  32.43 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2049  colicin uptake-like protein  32.18 
 
 		 146 aa  53.9  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3088  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  33.73 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00644238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1248  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  34.94 
 
 		 395 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000169991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  33.8 
 
 		 925 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  27.23 
 
 		 1682 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0842  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.51 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000389137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>