37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2565 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  100 
 
 		 311 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  82.45 
 
 		 319 aa  451  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  63.41 
 
 		 328 aa  361  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1526  TolA family protein  81.03 
 
 		 311 aa  350  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124316  normal  0.623667 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  62.17 
 
 		 341 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  62.35 
 
 		 340 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  62.06 
 
 		 340 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  61.99 
 
 		 342 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  68.44 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2369  TolA family protein  62.35 
 
 		 340 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000264795  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2732  protein TolA  79.87 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00666488  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  65.96 
 
 		 329 aa  323  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2532  TolA family protein  62.06 
 
 		 340 aa  322  7e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000043804  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2441  TolA family protein  61.47 
 
 		 340 aa  322  7e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000397376  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2749  tolA protein  58.26 
 
 		 345 aa  315  9e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2087  hypothetical protein  60 
 
 		 327 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  43.83 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  44.79 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  37.12 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  32.03 
 
 		 356 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  34.07 
 
 		 335 aa  126  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01609  hypothetical protein  34.64 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003914  TolA protein  36.73 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0635795  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  34.69 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  35.03 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  29.55 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  28.75 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  25.56 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0261  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  27.16 
 
 		 351 aa  50.4  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00647443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2049  colicin uptake-like protein  32.18 
 
 		 146 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2230  TonB family protein  28.41 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0726  TolA family protein  41.79 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0649134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  28.57 
 
 		 318 aa  45.8  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  32.14 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  32.84 
 
 		 2196 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0842  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  28.57 
 
 		 424 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1248  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  29.91 
 
 		 395 aa  43.5  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000169991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>