49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2732 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2732  protein TolA  100 
 
 		 309 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00666488  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  79.87 
 
 		 311 aa  407  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  73.73 
 
 		 319 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  58.28 
 
 		 341 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  58.16 
 
 		 340 aa  318  5e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  58.46 
 
 		 340 aa  318  5e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  58.11 
 
 		 342 aa  318  9e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  55.56 
 
 		 328 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2369  TolA family protein  58.63 
 
 		 340 aa  299  5e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000264795  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1526  TolA family protein  74.03 
 
 		 311 aa  296  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124316  normal  0.623667 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2441  TolA family protein  57.74 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000397376  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2532  TolA family protein  58.33 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000043804  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  62.15 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2749  tolA protein  54.39 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  59.94 
 
 		 320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2087  hypothetical protein  42.55 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  40.97 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  41.72 
 
 		 304 aa  142  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  37.04 
 
 		 293 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  30.97 
 
 		 356 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  32.08 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01609  hypothetical protein  31.53 
 
 		 342 aa  93.6  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0726  TolA family protein  37.69 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0649134  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  32.01 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  33.21 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003914  TolA protein  32.17 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0635795  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0261  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  27.36 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00647443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2049  colicin uptake-like protein  34.48 
 
 		 146 aa  53.1  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  27.38 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  27.89 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  23.32 
 
 		 271 aa  50.1  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0842  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  31.67 
 
 		 424 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  24.88 
 
 		 273 aa  49.3  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2340  hypothetical protein  28.12 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00623137  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1248  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.77 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000169991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  34.74 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2230  TonB family protein  29.23 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  32.35 
 
 		 2196 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  24.44 
 
 		 1682 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  43.59 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2916  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  29.31 
 
 		 423 aa  42.7  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000145417  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0762  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  29.31 
 
 		 426 aa  42.7  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000171784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0792  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  29.31 
 
 		 421 aa  42.7  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000022577  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0661  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  29.31 
 
 		 395 aa  42.7  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498099  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00699  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  29.31 
 
 		 421 aa  42.7  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00012175  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0768  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  29.31 
 
 		 432 aa  42.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00688  hypothetical protein  29.31 
 
 		 421 aa  42.7  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000128446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2896  protein TolA  29.31 
 
 		 421 aa  42.7  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000491333  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  29.74 
 
 		 925 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>