36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01609 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01609  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  664    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003914  TolA protein  74.15 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0635795  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  64.12 
 
 		 356 aa  355  5e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  47.96 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  35.65 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  33.73 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  36.58 
 
 		 311 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  33.33 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2441  TolA family protein  33.14 
 
 		 340 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000397376  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2532  TolA family protein  33.14 
 
 		 340 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000043804  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2369  TolA family protein  32.86 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000264795  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  33.43 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  32.62 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  32.94 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  33.73 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  33.73 
 
 		 342 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  33.73 
 
 		 340 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  33.73 
 
 		 340 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2749  tolA protein  36.36 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0261  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  27.71 
 
 		 351 aa  62  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00647443  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1526  TolA family protein  34.31 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124316  normal  0.623667 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  31.58 
 
 		 332 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  31.25 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 1032 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  31.54 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36650  TolA protein  36.62 
 
 		 452 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1248  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  35.16 
 
 		 395 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000169991  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  30.41 
 
 		 341 aa  46.6  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  35.84 
 
 		 925 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  39.66 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2087  hypothetical protein  33.96 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.75 
 
 		 561 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1278  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  31.91 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000166753  hitchhiker  0.0000389021 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  34.81 
 
 		 2196 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2318  Protein of unknown function DUF1626  32.35 
 
 		 342 aa  42.7  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0252538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>