30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_36650 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_36650  TolA protein  100 
 
 		 452 aa  843    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1276  TonB family protein  77.1 
 
 		 326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274487  normal  0.431648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4537  TolA protein  82.79 
 
 		 345 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51730  TolA protein  82.79 
 
 		 347 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000424658  decreased coverage  0.00000451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3994  protein TolA  67.16 
 
 		 358 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.513554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4197  protein TolA  65.67 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1250  Tol-Pal system, TolA  65.67 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1221  biopolymer transport protein TolA  64.93 
 
 		 372 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.882269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1414  TonB, C-terminal  64.18 
 
 		 356 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170707  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3973  tolA protein  64.18 
 
 		 356 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0266991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4403  TonB-like  78.26 
 
 		 359 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  41.39 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  44.95 
 
 		 253 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1852  TonB-like protein  36.36 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  38.3 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  37.3 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0469  TonB family protein  35.64 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1228  TolA protein, putative  35.65 
 
 		 467 aa  55.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  41.83 
 
 		 2196 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  32.38 
 
 		 332 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  32 
 
 		 351 aa  50.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  35.06 
 
 		 271 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  35.06 
 
 		 273 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  32.5 
 
 		 332 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09211  hypothetical protein  25.47 
 
 		 319 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  67.39 
 
 		 914 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  34.63 
 
 		 925 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  32.39 
 
 		 290 aa  45.8  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  32.32 
 
 		 341 aa  43.9  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  31.98 
 
 		 331 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>