35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1414 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3973  tolA protein  99.16 
 
 		 356 aa  681    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0266991  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1414  TonB, C-terminal  100 
 
 		 356 aa  686    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4403  TonB-like  85.94 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3994  protein TolA  81.95 
 
 		 358 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.513554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1250  Tol-Pal system, TolA  81.34 
 
 		 372 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1221  biopolymer transport protein TolA  80.6 
 
 		 372 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.882269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4197  protein TolA  81.2 
 
 		 372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36650  TolA protein  59.09 
 
 		 452 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51730  TolA protein  62.3 
 
 		 347 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000424658  decreased coverage  0.00000451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4537  TolA protein  62.3 
 
 		 345 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1276  TonB family protein  57.58 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274487  normal  0.431648 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  31.91 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  42.24 
 
 		 253 aa  94  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  31.78 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1852  TonB-like protein  32.79 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  38.95 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  34.52 
 
 		 2196 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0469  TonB family protein  30.88 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  29.13 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  30.53 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  29.82 
 
 		 271 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  35.44 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  30.61 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  63.64 
 
 		 914 aa  46.6  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1331  hypothetical protein  48.61 
 
 		 247 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1195  hypothetical protein  52.11 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  39.82 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  37.7 
 
 		 330 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  37.29 
 
 		 334 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4013  hypothetical protein  48.05 
 
 		 244 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.012412  hitchhiker  0.000000000204146 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  27.13 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  43.04 
 
 		 901 aa  42.7  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  25.53 
 
 		 346 aa  42.7  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1228  TolA protein, putative  35.48 
 
 		 467 aa  42.7  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0948  protein TolA  24.6 
 
 		 346 aa  42.7  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.929529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>