13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0948 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  97.4 
 
 		 346 aa  686    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0948  protein TolA  100 
 
 		 346 aa  703    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.929529  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01563  protein TolA  52.11 
 
 		 322 aa  262  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.479302  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3120  protein TolA  48.6 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  24.03 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0535  protein TolA  37.08 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000935471  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2230  TonB family protein  37.5 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  34.78 
 
 		 253 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  35.96 
 
 		 320 aa  50.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  27.82 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2216  TonB domain-containing protein  32.95 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  29.71 
 
 		 273 aa  43.9  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49618  predicted protein  32.14 
 
 		 958 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>