18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0897 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  658    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  23.97 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0948  protein TolA  24.03 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.929529  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  36.43 
 
 		 2196 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  36.76 
 
 		 925 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3120  protein TolA  28.82 
 
 		 351 aa  50.4  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0858  Fis family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.487763  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  29.67 
 
 		 273 aa  47  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1092 aa  46.6  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.21 
 
 		 1079 aa  46.2  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2216  TonB domain-containing protein  31.82 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  26.92 
 
 		 320 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  35.56 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  25.9 
 
 		 1995 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6458  hypothetical protein  23.67 
 
 		 9529 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  25.58 
 
 		 1682 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  29.19 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0874  60S ribosomal protein L19  30.88 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>